现代新药研发的首要任务是筛选、确定和制备有效的药物靶点。CRISPR-Cas9在多种类型的细胞和组织中都具有高效精确的基因编辑能力,据近期文献[1-3]报道,以CRISPR-Cas9为基础的基因编辑技术在一系列药物靶点筛选中展现出了极大的应用前景。

通过构建sgRNA文库,利用慢病毒转染细胞,对疾病发生、维持癌细胞生长、存活及发展等过程具有重要作用的蛋白及其结构域的大规模筛选,结合NGS及数据分析,对寻找合适的药物作用靶点,研发新药尤其是癌症治疗药物具有重要意义。

研究思路

新药研发靶点筛选研究思路
  1. 基因组或者Panel
    范围内的基因调取与
    sgRNA设计
  1. Syno?2.0基因
    合成
    载体构建
  2. sgRNA文库构建
  3. 慢病毒文库制备
  1. 细胞活力、增殖、凋
    亡等表型检测
  2. 结合免疫染色、流式
    细胞术等方式得到筛
    选后的细胞
  1. 利用NGS及生物信息分析
    获取筛选前后的基因组信息
  2. 获得富集sgRNA所对应的
    候选基因
  3. 后续细胞株构建或动物模
    型建立

新药研发靶点筛选服务优势

right一站式服务
泓迅科技提供从sgRNA设计、sgRNA文库构建、慢病毒包装,到靶点筛选及后续验证工作的整体解决方案

right专利Syno? 3.0芯片合成平台
高通量、低成本合成sgRNA文库,文库构建覆盖率95%以上

right高通量功能筛选平台
提供全基因组文库筛选,平行分析大量细胞的基因功能,包括细胞活力、增殖、凋亡等表型检测,鉴定相关候选基因

right生物信息分析
经验丰富的生物信息分析团队,可通过分析NGS数据,筛选出靶点候选基因

新药研发的靶点筛选应用案例

【应用案例1】 基因敲除方法筛选与人类肿瘤生长和抗药性相关的基因

【应用案例2】基因组筛选方法检测小鼠体内肿瘤细胞的生长和转移情况

【应用案例3】 lentiCRISPR系统载体改良及GeCKO文库用于功能基因组文库筛选

参考文献
[1].Parnas, O., et al., A Genome-wide CRISPR Screen in Primary Immune Cells to Dissect Regulatory Networks. Cell, 2015. 162(3): p. 675-86.
[2].Sanjana, N.E., Genome-scale CRISPR pooled screens. Anal Biochem, 2016.
[3].Varshney, G.K., et al., A high-throughput functional genomics workflow based on CRISPR/Cas9-mediated targeted mutagenesis in zebrafish. Nat Protoc,2016. 11(12): p. 2357-2375.