sgrna生信分析
DNA测序的发展及其大规模应用促进了精准医疗、个性化用药的发展。通过测序技术可在细胞之间比较某个基因的突变状态,但通?;嵊行矶嗥渌煸拥奶卣餍畔⒀诟腔蛐秃图膊±嘈椭涞闹苯庸叵?。近年来,随着CRISPR-Cas9基因编辑技术的成熟与普及,研究人员可以编辑活体细胞基因组,精确地改变DNA序列,最终为开发出人类遗传疾病的新疗法奠定基础。

泓迅科技针对CRISPR-Cas9基因编辑技术,提供专业的sgRNA生物信息学服务。通过sgRNA序列设计,人工合成并成功进行基因敲除后,对测序结果进行基因表达谱分析、染色体DNA拷贝数统计等,最终实现从sgRNA设计、合成到功能分析的一体化服务。

泓迅科技拥有成熟一流的DNA合成技术和经验丰富的生物信息工程师,可根据客户具体需求,定制生物信息学数据分析服务。我们能够结合PRECOG、TCGA以及COSMIC等专业数据库,分析筛选基因表达高低信息、基因突变频率信息、预临床后相关性数据,进行整合性生物基因组学分析,为潜在药物靶点和个性化医疗提供解决方案。同时,还可以辅助研究人员找到其它可以作为治疗性靶点的附加基因。

sgRNA一体化服务流程:

服务优势:

1.丰富的CRISPR-Cas9 sgRNA设计经验,覆盖13种模式物种,可针对具体需求个性化设计。
2.专业的生物信息学服务团队,科学的方案设计,深入的数据挖掘,安全灵活的数据报告呈递方式。

应用领域:

农业、微生物、环境学、海洋学、人体微生态等

泓迅案例:

  • 实验方案整体描述:
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  • 用携带sgRNA的CRISPR-Cas9文库病毒感染细胞,对经过文库筛选后不同时期的细胞基因组进行二代测序。首先对sgRNA进行敲除效果评价,其次通过分析、比较,获得被富集或缺失的基因,进行GO,KEGG等功能注释,从而筛选出对细胞生存或者药物作用所必需的基因和靶点,最后结合已有的癌症数据库、突变数据库等信息,对靶点的信息进一步分析。

  • 结果展示:
  • sgRNA的基因敲除效果评价 sgRNA敲除后对基因表达的影响
    sgRNA的基因敲除效果评价
    sgRNA敲除后对基因表达的影响

     sgRNA敲除后对信号通路的影响 挖掘潜在药物靶点
    sgRNA敲除后对信号通路的影响
    与TCGA数据库的数据结合,挖掘潜在药物靶点

    knockout-site-analysis

    sgRNA对基因外显子的敲除位点分析

    服务详情:

    服务名称 分析内容 分析软件 交付周期 交付项目 价格
    sgRNA生物信息学服务 基因组,转录组,药物靶点挖掘等 R software 7-10 天 分析报告 询价

    sgRNA生物信息学服务订购

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